Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc115Q8VE99 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms