Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE65

Taf12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf12Q8VE65 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf12Q8VE65 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf12Q8VE65 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms