Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fyco1Q8VDC1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fyco1Q8VDC1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fyco1Q8VDC1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fyco1Q8VDC1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fyco1Q8VDC1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fyco1Q8VDC1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms