Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCL2

Sco2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco2Q8VCL2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sco2Q8VCL2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms