Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ApobrQ8VBT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ApobrQ8VBT6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms