Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms