Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms