Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc12Q8K5B8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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