Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdh16f2Q8K3M1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms