Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrtm1Q8K377 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm1Q8K377 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms