Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm48Q8K2X2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm48Q8K2X2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms