Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sde2Q8K1J5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms