Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh3Q8K1E6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms