Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx5Q8K1E0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms