Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33aQ8K0Y2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms