Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LgsnQ8CIX8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms