Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms