Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp2Q8CGR7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms