Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc43a2Q8CGA3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms