Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc28bQ8CEG5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms