Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms