Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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