Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrn3Q8CBC6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrn3Q8CBC6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms