Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slfn5Q8CBA2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms