Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms