Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnrQ8BYI9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms