Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms