Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms