Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SprnQ8BWU1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms