Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms