Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdd3Q8BP97 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rhbdd3Q8BP97 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rhbdd3Q8BP97 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdd3Q8BP97 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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