Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gga3Q8BMI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gga3Q8BMI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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