Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbfox3Q8BIF2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbfox3Q8BIF2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms