Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubash3bQ8BGG7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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