Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms