Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Katnb1Q8BG40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms