Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.3Q85ZW6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms