Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZW0

Stk35, Serine/threonine-protein kinase 35, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk35Q80ZW0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk35Q80ZW0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk35Q80ZW0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms