Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms