Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Pcsk9Q80W65 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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