Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf4Q80VU4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms