Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap100Q80VN0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap100Q80VN0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms