Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sestd1Q80UK0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sestd1Q80UK0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms