Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxna4Q80UG2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plxna4Q80UG2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plxna4Q80UG2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plxna4Q80UG2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plxna4Q80UG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plxna4Q80UG2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plxna4Q80UG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plxna4Q80UG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms