Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rpap1Q80TE0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap1Q80TE0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap1Q80TE0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms