Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcdh8Q7TSK3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms