Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms