Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms