Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Clec4b1Q7TS58 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clec4b1Q7TS58 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec4b1Q7TS58 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms