Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms