Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd1l2Q7TN88 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms